（一）出入境船舶 1、入境船舶负责人或其代理人在船舶预计抵达口岸24小时前（航程不足24小时的，在驶离上一口岸时），通过中国国际贸易单一窗口（https://www.singlewindow.cn）向海关申报并提交相关材料，办理入境检疫手续。 在离境前4小时内通过中国国际贸易单一窗口（https://www.singlewindow.cn）向海关申报并提交相关材料，办理出境检疫手续。已办理出境手续但出现人员、货物的变化或者因其他特殊情况24小时内不能离境的，须重新办理手续。船舶在口岸停留时间不足24小时的，经海关同意，船方或者其代理人在办理入境手续时，可以同时办理出境手续。 2、海关对申报内容进行审核，确定检疫方式，并及时通知船方或者其代理人。 3、海关对经检疫判定没有染疫的入境船舶，签发《船舶入境卫生检疫证》，如为两岸直航船舶则签发《船舶进港检疫证书》。对经检疫判定染疫、染疫嫌疑或者来自传染病疫区应当实施卫生除害处理的或者有其他限制事项的入境船舶，在实施相应的卫生除害处理或者注明应当接受的卫生除害处理事项后，签发《船舶入境检疫证》，如为两岸直航船舶则签发《船舶进港卫生检疫证书》。 经审核船方提交的出境检疫资料或者经登轮检疫，符合有关规定的，海关签发《交通工具出境卫生检疫证书》；如为两岸直航船舶则签发《船舶出港卫生检疫证书》。 （二）出入境航空器 1、入境航空器的负责人或代理人须在航空器入境前30分钟通过中国国际贸易单一窗口（https://www.singlewindow.cn）向海关申报办理入境检疫手续，在航空器关闭舱门前30分钟通过水空运输工具子系统向海关申报办理出境检疫手续。 2、海关对申报材料进行审核，评估检疫风险，确定检疫方式，并实施查验。 3、海关对经检疫判定没有染疫的入境航空器，签发《运输工具检疫证书》，如为两岸直航航空器则签发《航空器进港检疫证书》。对经检疫判定染疫、染疫嫌疑或者来自传染病疫区应当实施卫生除害处理的或者有其他限制事项的入境航空器，在实施相应的卫生除害处理或者注明应当接受的卫生除害处理事项后，签发《运输工具检疫证书》，如为两岸直航航空器则签发《航空器进港卫生检疫证书》。 经审核航空器提交的出境检疫资料或者经登临检疫，符合有关规定的，海关签发《交通工具出境卫生检疫证书》；如两岸直航航空器则签发《航空器出港卫生检疫证书》。 （三）出入境列车 1、入境列车的负责人或代理人须在列车入境前或入境时，向海关申报办理入境检疫手续，如申请电讯检疫，应当在列车预计抵达入境口岸30分钟前申报。出境列车的负责人或代理人须在离开出境口岸30分钟前向海关申报。 2、海关对申报材料进行审核，评估检疫风险，确定检疫方式，并实施查验。 3、入境列车经海关检疫判定没有染疫的，签发《运输工具检疫证书》；对经检疫判定染疫、染疫嫌疑或者来自传染病疫区的入境列车，在处理合格后，签发《运输工具检疫处理证书》。 出境列车经海关审核列车负责人或出境列车经海关审核列车负责人或代理人提交的出境检验检疫资料或者经登车检验检疫，符合有关规定的，签发《交通工具出境卫生检疫证书》。对需检疫处理的，实施相应的检疫处理措施，消除公共卫生风险后，签发《交通工具出境卫生检疫证书》。